主要有兩種途徑會導致免疫系統開始出現障礙:一是對本來不會對身體造成危害的外物(如花粉)反應過度，導致出現過敏反應，或是免疫系統在某種情況下不能正確地分辨自我和外物，把自身的某些細胞和組織當作入侵的抗原而圍攻，導致自體免疫疾病，如關節炎、紅斑性狼瘡;二是免疫功能下降，不能有效地對人侵抗原作出適當的反應，導致癌細胞生長、疤疹病毒擴散或使疾病(如慢性疲勞症候群)發展、惡化。免疫系統出現問題前，會預先表現出一些較輕的疾病，如流感、傷風。
免疫器官在全身各處都有分布，包括淋巴結(沿著淋巴管成群分布)、骨髓(位於骨骼骨髓腔中的柔軟的脂肪組織)、胸腺(位於胸腔前縱隔上部)和脾(位於腹部左側)。這些免疫器官能夠產生和儲存白血球、分化免疫細胞，這些免疫細胞能夠幫助人體檢測人侵抗原，產生抗體消滅抗原。
著名的臨床研究員K. H.庫克爾(K. H. Coker)說:“已經有證據證明瑜伽/冥想能夠影響褪黑激素的分泌。褪黑激素是松果體分泌的一種荷爾蒙，褪黑激素缺乏易導致乳腺癌或前列腺癌。初步的研究顯示,修練瑜伽/冥想與人體內的褪黑激素水平有一定關係。”
2003年，美國奧勒岡州健康與科學大學神經病理學教授巴瑞·奧肯(Barry Oken, M. D )經過研究證明，六十名多發性硬化症患者修練瑜伽後，疲勞感明顯降低。
健康瑜伽方案II中的修練動作能協調和增強特定器官、腺體中的血液循環，對各種慢性疾病發揮有效的治療作用。
推薦動作
一、肩立式
(根據自己的能力選擇標準式或變化式)
調節甲狀腺功能，穩定新陳代謝，幫助治療甲狀腺功能亢進或低下;刺激頸部的壓力受器，降低血壓、減緩心跳。刺激位於腦部中央的松果體和垂體，平衡交感神經系統和副交感神經系統，幫助治療各種免疫系統疾病杯如癌症、慢性疲勞症候群、愛滋病和流感
體式動作詳情：http://www.yujiame.com/yujiatishi/zhongji/20141305.html
二、魚式
改善甲狀腺的血液循環，穩定新陳代謝，幫助治療甲狀腺功能亢進或低下;增加心血管系統的血液供應，支持各種腺體和器官，如胸腺(位於胸腔心臟上部)、脾臟(位於左上腹)等，促進免疫系統產生的白血球找到目標。
體式動作詳情：http://www.yujiame.com/yujiatishi/gaoji/20141253.html
三、深度放鬆式
深度放鬆身心，增強免疫系統功能，幫助人體抵抗感染和各種疾病。
仰臥，雙臂和雙腿自然伸展，雙腿相距約四十五公分，雙臂距離身體各約十公分，掌心向上。閉上眼睛，自然呼吸，全身放鬆。將意識停留在右腳和右腿。繃緊右腿肌肉，抬高右腿至其離開地面數十公分，繃緊，慢慢地放回地上，左右轉動右腿，然後將意識停留在左腿，重複上述動作。
吸氣，將意識轉移至骨盆和臀部，繃緊，再放鬆，平穩地呼吸。在日常活動中，我們常常會使骨盆和臀部承受較多的壓力，從而導致生殖系統或骨盆、臀部的功能紊亂。吸氣，使胃部充滿氣體，停留片刻，從口中呼出。再吸氣，使胃部充滿氣體，然後轉移至胸部，停留片刻，從口中呼出。
將意識停留在右手和右臂，吸氣，右手輕輕握拳，繃緊手臂肌肉，然後放鬆。將意識轉移至左手和左臂，重複動作。
吸氣，雙肩抬高，貼近耳朵，停留片刻，放鬆，頭部慢慢左右轉動，然後回到中央，放鬆。將意識停留在臉部，張開嘴，下巴向下，慢慢左右移動，收回中央，放鬆。然後收緊臉部肌肉，再放鬆，長大嘴巴，舌頭盡量向前伸出，放鬆。在這個時候，你全身會得到完全的放鬆。
現在進人深度放鬆第二階段:不要動，將意識停留在腳上，放鬆雙腳。將意識轉移至全身，依次放鬆各個部位，直至頭部。達到全身的放鬆後，再將意識轉移至呼吸，當呼吸變得非常輕微的時候，將意識轉移至腦海中，注意觀察各種想法在腦海中的進出，這時你可能會發現腦海中充滿各式各樣的想法，特別是剛剛開始修練深度放鬆式的時候。這是
正常現象，注意，不要刻意拋開這些想法，不要強迫性地做任何事情，你要做的僅僅是注視著它們，就像在看電影一樣。練習幾次以後，你會發現自己的頭腦變得越來越放鬆，繼續進行下去，你會感到非常的放鬆與快樂，能夠讓你恢復生命活力、心曠神怡。
保持這種放鬆與平靜狀態片刻，再慢慢將意識轉移至呼吸，使呼吸逐漸加深，再將意識轉移至雙腳，慢慢向上轉移，逐步喚醒身體各個部位，直至頭部。然後緩慢地移動身體各個部位，體會放鬆和舒適感。
四、經絡調息
平衡交感神經系統和副交感神經系統，增強松果體、胸腺和脾臟的能.提高白血球的活性和免疫系統的功能。
舒適打坐，右手輕輕握拳，鬆開拇指、無名指和小指，右臂彎曲置於胸前，放鬆。用右手拇指按住右鼻孔，使最大量的氣體從左鼻孔呼出。然後通過左鼻孔吸氣，再用右手的無名指和小指按住左鼻孔，將氣體從右鼻孔呼出。
吸氣時，盡量擴張腹部，使最大量的氣體進人肺部。呼氣時，要將氣體完全從肺部排出。按照這樣的方法左、右鼻孔交替呼吸幾次，最後將氣體從右鼻孔呼出，恢復正常呼吸。保持坐姿，休息片刻，體會剛才的修練給為身心所帶來的平靜與安寧。
