由於身體的清洗能帶動心靈的淨化，瑜伽行者發現了內部清洗法，藉由簡單的動作，讓人保有潔淨的身心，他對於許多疾病都有很好的療效。
鼻腔清洗法
此法可維護鼻子及鼻腔內部之清潔。如果每天練習，就能有效對抗髒空氣、灰塵或花粉，改善氣喘、過敏及其他呼吸疾病症狀。
洗胃法
此法能將胃壁上多餘的黏液及食物清除掉，對食道也有清潔作用。將長5公尺、寬5公分的紗布浸在稀釋過的鹽水裡（跟洗鼻用的一樣），然後放到嘴裡。第一次可先試著吞進30公分，以後每次練習多吞一點，直到能吞進整條紗布為止。
1 將紗布一端放進嘴裡咀嚼，邊嚼邊吞，直到只剩一小段。
2 讓紗布停留在胃裡幾分鐘，以清理胃壁，然後在從嘴巴拉出來。練習前請先空腹，建議每星期可清洗兩次。 洗眼法
將點燃的蠟燭置身於身前一手臂長、眉心高處。直盯著火焰1到3分鐘，不要眨眼，淚液會清洗眼睛及淚管，最後閉眼觀想眉心。洗眼法能改善視力及提升專注力，並可作為靜坐的準備動作。
飲水法
水是所有疾病的良藥。如果知道如何正確使用水，幾乎會使所有的疾病減輕。
“水’在印度密教傳統中被稱為“神飲”。瑜伽體系認為水對人體有潔淨的作用，井建議習瑜伽者每天盡可能多喝水，因為人的生理機制不盡相同，很難制定劃一的標準，只要量控制在習諭伽者感覺適宜的極限內就好了。
為了維持身體內在的功能正常以及保證內在液體的平衡，每個人每天應該喝足量的水。一個健康的人每天應該喝三至四公升的水；病人應喝四至五公升，皮膚病患者則應喝五至六公升。足最的水可使疾病有很大的改善。光喝水很好，如果能加點檸檬汁及一點鹽則更佳。這種有益健康的液體可以培養出健康的體格，預防身心方面的疾病。但是一次性喝大量的水有害身體，對患有心肚病的人尤其有害。
